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El Programa de Biología Estructural y Biocomputación y la unidad del Instituto Nacional de Bioinformática del CNIO han participado en el mayor proyecto Europeo enmarcado en IHEC, el BLUEPRINT
Su labor se ha centrado en hacer accesibles los datos generados y coordinar el análisis de los mismos
El Consorcio Internacional para el estudio del Epigenoma Humano (IHEC, por sus siglas en inglés) publica de forma simultánea una colección de 41 trabajos que recogen los últimos avances en el estudio del epigenoma -24 de los cuales aparecen hoy en varias revistas del grupo Cell Press. El Programa de Biología Estructural y Biocomputación y la unidad del Instituto Nacional de Bioinformática del Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO) participan en varios de ellos y lideran tres de estos trabajos.
Uno de los mayores misterios de la biología es cómo de una sola célula con una secuencia única de ADN, nuestro genoma, se forman los distintos tipos celulares que originan nuestro organismo. Hemos aprendido mucho estudiando el genoma humano, pero conocemos muy poco sobre los procesos que van a determinar cada tipo celular. Esta identidad celular viene definida por un conjunto de factores que modifican el genoma generando una ‘huella dactilar’ única -epigenoma- para cada tipo celular y etapa del desarrollo. Al contrario de lo que sucede con el genoma, el epigenoma cambia durante el desarrollo y en respuesta a factores externos que modifican el ambiente. Alteraciones vinculadas a los factores que modifican la huella epigenética se han relacionado con distintas enfermedades. Por lo tanto, el estudio del epigenoma de las células sanas y alteradas es indispensable para el desarrollo de nuevas formas de diagnóstico y tratamiento en diferentes enfermedades, que permitan una mejora de la salud.
Esta colección de 41 estudios realizados por investigadores de IHEC permite mejorar nuestra comprensión sobre estos procesos e impulsa la investigación mundial en el campo del epigenoma un paso más allá. Veinticuatro de estos trabajos se han publicado hoy en la revista Cell y otras del grupo Cell Press, y los 17 restantes se publicaron en otras revistas de gran impacto científico.
El Programa de Biología Estructural y Biocomputación y la unidad del Instituto Nacional de Bioinformática del CNIO, con Alfonso Valencia a la cabeza, han participado en el mayor proyecto Europeo enmarcado en IHEC, el BLUEPRINT, haciendo accesibles los datos generados y coordinando el análisis de los mismos.
“Nuestro trabajo ha sido hacer accesibles los datos a otros grupos”, explica Valencia. “El proyecto ha generado un gran volumen de datos de epigenómica y había que desarrollar los métodos y los sistemas para analizarlos”. Y eso es lo que han hecho, con el objetivo de “facilitar el análisis de la información biológica”.
Además de este papel en la organización y distribución de los datos, el grupo de Valencia ha liderado varios trabajos en los que han desarrollado sus propios sistemas de análisis. Por ejemplo, el uso de la asortatividad para el análisis de la disposición tridimensional del genoma, publicado en Genome Biology.
“Ha sido una experiencia muy positiva porque nos ha provisto de herramientas que han servido para el análisis de los datos de este proyecto y que en un futuro servirán para el análisis de los datos que se generen en epigenómica”, asegura Valencia.
“BLUEPRINT ha generado más conocimientos nuevos acerca de las enfermedades de la sangre de que lo que podríamos haber imaginado al inicio. Hemos puesto a disposición del público información de más de 1.000 colecciones de datos”, subraya Henk Stunnenberg, de la Universidad de Radboud (Holanda), coordinador del proyecto. “Más aún, hemos forjado una alianza de investigadores y compañías de innovación de toda Europa y, trabajando codo con codo con socios internaciones, ya estamos viendo resultados que, con el tiempo, mejorarán la vida de los pacientes”.
Estos artículos representan el trabajo más reciente de los proyectos de los miembros de IHEC procedentes de Canadá, la Unión Europea, Alemania, Japón, Singapur y Estados Unidos. La colección de publicaciones muestra los avances y logros científicos realizados por los miembros de IHEC en áreas clave de las investigaciones sobre el epigenoma.
El acceso a esta colección de publicaciones puede realizarse a través de esta web.
Parte del equipo del CNIO que ha participado en el proyecto BLUEPRINT. Sentados, de izquierda a derecha: José María Fernández, Felipe Were y Alfonso Valencia. De pie, de izquierda a derecha: David Juan y Enrique Carrillo de Santa Pau. /CNIO